开启迷失岛2二周目的核心条件是完成一周目全部主线任务，包括四大岛任务和最终BOSS挑战，同时需确保角色等级达到100级并收集所有神秘宝箱与隐藏秘宝。满足条件后，主菜单会出现新游戏+选项，选择即可进入二周目。二周目将继承角色等级、技能点、装备及道具，但岛屿资源、怪物强度和谜题难度会显著提升，并新增双人模式、红狼挑战等玩法。
二周目新增内容主要集中在解谜要素和隐藏剧情上。开局后需注意桥下的三角形符文，这是二周目独有的关键道具之一。灯塔二层左侧墙上的纸条内容会变化，提示密室开锁方法，需结合三角形符文的图案排列解开。工厂内新增铁箱机关，需嵌入红眼石板并按照神庙密室中的章鱼图案点亮对应位置，最终获得铁锥道具。
神庙密室是二周目的核心场景，需集齐六块三角形符文才能开启。符文分布在外星人头部附近、火箭二层左侧、古代神庙最深处及海边铲挖点。解开密室后需输入密码49180375，该密码通过金字塔门口墙壁的感谢名单图案与神秘雕像线索推导得出。放入铁锥后与NPC对话，获得金字塔密室密码4325，调整铁棒长度即可触发最终剧情。
二周目通关后，飞船将突破玻璃罩并解锁隐藏成就调查员。需注意部分谜题如工厂铁箱、休眠舱图形等解法为随机生成，需结合实时线索灵活应对。二周目并非简单重复一周目流程，而是通过新增道具、密室和剧情补全世界观，建议玩家在探索时详细记录NPC对话与环境细节。
完成二周目后仍可继续自由探索，未收集的成就或隐藏区域需对照初始画布图案查漏补缺。游戏设计上，二周目旨在深化叙事逻辑与挑战性，若遇到卡关可优先回溯一周目未触发的交互点或重新审视道具组合方式。
