自动战斗是无尽的拉格朗日中重要的战术机制，合理利用可以大幅提升战斗效率。游戏中的自动战斗主要通过舰队指令系统实现，包括增援、驻守、封锁等核心功能。舰队会根据预设指令自动执行攻击或防御行为，无需玩家手动操作每场战斗。需自动战斗的胜负取决于舰队配置、阵型编排以及目标优先级设定。
舰船在自动战斗中的行为逻辑遵循固定规则。阵型分为前排、中排和后排，舰船会根据自身定位自动归位。例如战巡舰默认前排，驱逐舰多为中后排。战斗中敌我双方会按战斗序列依次攻击前中后排目标，武器类型也会影响目标选择，直射类武器优先攻击同排目标，曲射武器则可能跨排攻击。防空无人机等特殊单位仅在被攻击时触发自卫反击，其伤害公式为个体数×输出×周期×轮数×60/(间隔+延迟)×对抗飞机效率×数量。
将舰队部署在NPC据点周边开启封锁后，舰队会自动攻击途经该区域的敌方单位。建议选择野怪刷新点如红色基地进行封锁，不同等级据点会刷新对应强度的野怪，例如3级据点出8级野怪。封锁期间需注意舰队血量，搭配后勤舰可延长挂机时间。封锁区域内的矿点采集权可能引发同盟矛盾，建议3名左右玩家共享矿区以平衡资源分配。
已出击舰队可通过增援快速补充战力，增援舰船会以曲率航行更快的速度抵达战场。该指令对盟友同样有效，适合大规模战役的集火战术。撤退指令则用于保护残血舰船，部分舰种如巡洋舰有30%概率触发紧急规避机制避免被毁。自动撤回功能会记忆上次设置，远距离作战时需注意检查该设定防止误操作。
自动战斗的效率受舰队构成影响显著。建议将工程舰与721运输舰混编提升采矿效率，战巡和航母等高指挥值单位可通过增援突破编队限制。战斗中同一武器系统的不同个体可攻击不同目标，例如光锥矿车的反舰导弹系统能同时锁定多艘敌舰。无人机等不可被攻击的单位在母舰被毁后自动消失，其存在时间直接影响防空效能。
