404营地的覆灭是明日之后剧情中的重要谜团，根据游戏内线索和官方CG分析，其灭亡与内部爆发的尸潮直接相关。该营地原本是贸易联盟建立的永远404避难所，号称永不陷落，却因未知原因突然被感染者攻破。矿坑中的精英感染体与404营地存在关联，夏尔镇作为404的前身，其矿坑区域出现的帝国士兵和变异体暗示了更深层的阴谋。
导致404覆灭的关键线索指向一名神秘的红衣小女孩。游戏宣传CG显示，她被救援队带回营地时小腿已有感染咬痕，这可能是尸潮爆发的源头。该角色在奇遇任务中多次出现，表现出对感染体的异常熟悉，甚至能在丧尸包围中保持镇定。结合贸易联盟内部文件孩子的名单等任务道具，可以推断小女孩可能是被刻意安插的感染源，其背后或存在更大势力的操控。
关于灭亡的另一种推测涉及势力斗争。404营地位于北方帝国与贸易联盟的交界处，地理位置敏感。部分NPC对话暗示教会组织可能通过散布病毒制造混乱，挑起两大势力冲突。帝国士兵对矿坑感染体的严密看守，以及夏尔镇地图中遗留的军事实验痕迹，都表明该区域曾被用作生物武器试验场。这种人为制造的感染爆发，比自然尸潮更具破坏性。
从游戏机制角度观察，404的设定延续了末日生存题材的核心矛盾——人类内部争斗往往比外部威胁更致命。无论是红衣小女孩的潜伏感染，还是势力间的生化实验，都反映出在资源匮乏的末世中，人性博弈可能摧毁最坚固的避难所。现存营地的巡逻机制和隔离措施，某种程度上正是对404事件教训的应对。
游戏内关于彩虹天堂的秘密任务、唐纳德与阿扎罗夫的支线剧情，以及远星城704营地的类似遭遇，都暗示着更庞大的阴谋网络。这些线索共同构建出明日之后的核心叙事：在病毒末世中，真正的危险往往来自那些试图掌控灾难的人。
