在游戏初期，玩家需要从大木博士的研究所选择初始精灵，包括妙蛙种子、杰尼龟和小火龙。这三只精灵各有特点，选择后将与劲敌小茂进行首次对战。离开真新镇后，沿着1号道路前往常磐市，在商店领取大木博士的包裹并返回交付，获得宝可梦图鉴。可前往小茂家获取城镇地图，为后续探索做准备。初始阶段建议多捕捉野生精灵并积累战斗经验，同时合理分配精灵球等道具。
完成基础任务后，玩家需穿越常磐森林前往尼比市。森林中有大量虫系精灵，偶尔可遇到皮卡丘。抵达尼比市后挑战岩石系道馆馆主小刚，其主力为大岩蛇和小拳石。战胜后可获得岩石徽章及技能机。随后前往月见山，此处需击败火箭队成员并选择化石（化石盔或菊石兽）。月见山内部地形复杂，建议提前准备解毒药和闪光技能以应对黑暗区域。
离开月见山后到达华蓝市，挑战水系道馆馆主小霞。其精灵包括宝石海星和角金鱼，使用草系或电系技能可有效克制。在华蓝市右上角触发正辉剧情，帮助其恢复人形后获得船票。可前往枯叶市乘坐圣安奴号游轮，在船上击败训练家并获取秘传机居合斩。该技能用于清除道馆前的障碍，是推进主线的关键道具。
第一周的核心目标还包括解锁电系道馆。枯叶市的道馆机关需通过调查垃圾桶触发，馆主马志士的雷丘和皮卡丘对地面系精灵较弱。战胜后获得橙色徽章，并开启后续地图的探索权限。玩家可前往地鼠洞穴或岩山隧道，利用闪光技能通过黑暗区域。第一周结束时，建议将主力精灵等级提升至25级左右，为后续挑战彩虹市道馆和火箭队剧情奠定基础。
